Caracterización de las secuencias de los Virus Zika y Dengue obtenidas de mosquitos Aedes Aedgypti

Abstract

El DENV y ZIKV son virus del género Flavivirus de la familia Flaviviridae involucrados en enfermedades emergentes y remergentes. El vector es un artrópodo que transmite el virus de vertebrado a otro por picadura. Estos virus poseen un genoma de RNA lo cual permite una gran variabilidad genética, las variantes generadas a través de rondas de replicación están sujetas a mecanismo evolutivos y pueden cambiar con el paso de un hospedero a otro. Los estudios de variación genética se han centrado en secuencias virales obtenidas de humanos y mosquitos infectados artificialmente, por lo que el estudio en poblaciones silvestre de mosquito permitirán una mejor comprensión. El objetivo de nuestro trabajo fue la caracterización de las secuencias de Flavivirus (DENV y ZIKV) obtenidas de mosquitos y humanos, determinar su relación filogenética y el análisis de variación genética. Materiales y métodos. Se obtuvieron muestra de mosquito adultos y de pacientes con diagnóstico de síndrome febril en 2016. Se les realizó detección de arbovirus mediante rtqPCR, a las muestras positivas se realizó extracción de RNA ribosomal y cuantificación de RNA, posteriormente se realizó RNAseq, ensamble de novo y referencia para la determinación de las secuencias de flavivirus y su genotipificación; se realizaron análisis filodinámicos y de variabilidad de genomas intra-hospedero. Resultados. Se detectaron 20 muestras de mosquito y 4 de humano positivas arbovirus, se seleccionaron 13 para secuenciación. Reconstruimos una secuencia de DENV4 genotipo II. Se realizó la reconstrucción de dos árboles filodinámicos uno de DENV2 genotipo asiáticoamericano y otro de ZIKV linaje asiático-americano. Los análisis de variación permitieron identificar un mayor número de variación en las proteínas NS2A y péptido 2K en DENV2 genotipo asiático-americano y en C, NS2A, NS2B y NS3 en ZIKV linaje asiático-americano. Conclusiones. Los análisis de variación de las secuencias nos permitieron identificar un mayor número de variación en las proteínas no estructurales involucradas en la formación del complejo replicativo, corte de proteasas, ensamble del virión y respuesta inmune, además la acumulación de variación se observó más en las secuencias de DENV2 y se correlaciona con una mayor ganancia de variantes observada en la filogenia en contraste con las secuencias de ZIKV donde fue menor.